家蝇、金蝇的行为习性与功能定位与黑水虻接近。但我们建议用黑水虻取代家蝇或其它蝇类养殖，来达到餐厨垃圾和禽畜粪便的处理、以及生产高品质昆虫蛋白的目标。
家蝇蛆（小虫）和金蝇蛆（大虫），为实际比例图
（黑水虻蛆，实际比例）
首先，黑水虻个体较大。黑水虻成熟幼虫个重是家蝇蛆的十倍左右，个体十分可观，方便进行虫料分离和进一步的加工处理。
其次，黑水虻幼虫历期长，并且有明显的预蛹期，能够实现较长时间的活体存储，根据环境条件，时长可达一周到数月。而一般的蝇类幼虫缺乏明显的预蛹期，发育较快，活体贮存较难。
第三，黑水虻成虫不取食，只需要补充水分即可，生命周期只有数天，即可完成交配产卵，每雌产卵近1000粒。而家蝇、金蝇成虫不断取食，寿命可达一个月以上，养殖时需要不断补充食物。
第四，黑水虻成虫不扰民，不随易进入人类居室、厨房。而家蝇、金蝇却是典型的公害。家蝇不仅烦人，甚至可能传播疾病。
第五，黑水虻可选择食物种类广泛，从禽畜粪便、动植物残体，餐厨垃圾，到食品工业废料，都能轻易处理。家蝇与黑水虻食性相近，但金蝇喜食动物尸体，要求高蛋白饲料才能养殖。
不过，黑水虻养殖也有一些不足，如成虫养殖需要大空间，较高的温度，强的光照。这些因素也是长期以来制约黑水虻应用的重要因素，目前这些环节的困难均能够通过技术解决。因此我们建议在生产中用黑水虻取代家蝇养殖。